Als weltweit eine der ersten Hochschulen wurde die EBC Hochschule als Bildungsträger nach der neuen Norm DIN ISO 29990 zertifiziert. Zeitgleich erhielt sie die Zertifizierung nach DIN EN ISO 9001. Die EBC Hochschule gehört damit zu einer der wenigen Hochschulen mit einem überprüften Managementsystem nach internationalen Standards. Besonders hervorzuheben ist die Zertifizierung nach DIN ISO 29990, deren Bildungsqualitätsanforderungen nachweislich an der EBC Hochschule umgesetzt werden. Die Norm bezeichnet ein Qualitätsmanagement für die Aus- und Weiterbildung, welches sich auf den Lernprozess fokussiert. Sie garantiert ferner, dass die Hochschule objektiv erkennbare Qualitätssicherung und Transparenz bietet und nachweislich ein Qualitätsmanagement in den Geltungsbereichen Entwicklung, Controlling, Erstellung von Lernmitteln sowie Durchführung und Evaluation von Hochschulstudiengängen eingeführt und angewendet hat.